Sequenzierung

“Sanger“-Sequenzierung

Unser Sequenzier-Service umfasst Cycle-sequencing, Kapillar-Elektrophorese und Transfer der Sequenziergebnisse via E-mail. Alle Cycle-sequencing–Reaktionen werden automatisiert mittels „CleanSeq®“-Beads gereingt.

Die Auftrennung der Sequenzierreaktionen (Fragmentanalyse [Elektrophorese-Service] auf Anfrage) erfolgt mit Hilfe eines ABI3730- (48 Kapillaren) bzw. 3130XL-DNA Sequenzierers (16 Kapillaren) mit einer garantierten Leselänge von 700 Basen.

NGS (Next Generation Sequencing)

Alle Sequenzierungen werden auf Illumina Sequenzierern (MiSeq Desktop oder NextSeq) durchgeführt. Diese erlauben die Sequenzierung von bis zu 30 (NextSeq: 800) Millionen Reads bei einer maximalen Readlänge von 2x300bp (NextSeq: 2x150bp).

Der Gesamtoutput pro Lauf beträgt bis zu 15Gb (NextSeq: 120Gb).

PremixSingleRun €3,30

  • Sequenzierung gereinigter PCR-Produkte und Plasmide
  • Sie mischen vorab DNA und Primer mit definiertem Volumen und Konzentration*
  • Kein Editieren, keine Wiederholung

Empfohlene Formate: 1,5 ml, 0,5 ml oder 0,2 ml Reaktionsgefäß (Kein Schraubdeckel! Kein Parafilm!)
Weitere Formate (96-wells, 8er-Strips) auf Anfrage

PremixPrepaid €3,00

  • Leistung und Spezifikation wie „PremixSingleRun“
  • Mindestabnahmemenge 250 Sequenzierungen

Empfohlene Formate: 1,5 ml, 0,5 ml oder 0,2 ml Reaktionsgefäß (Kein Schraubdeckel! Kein Parafilm!)
Weitere Formate (96-wells, 8er-Strips) auf Anfrage

ComfortRun  €3,90

  • Sequenzierung gereinigter PCR-Produkte und Plasmide
  • Sie schicken DNA mit definiertem Volumen und Konzentration*
  • Primer separat oder Auswahl aus unserer Primerliste**
  • Wiederholung bei eingeschränkter Qualität nach Rücksprache möglich
  • Aufpreis bei ungereinigten PCRs (clean-up durch Exo-SAP Inkubation): €0,30

Empfohlene Formate: 1,5 ml, 0,5 ml oder 0,2 ml Reaktionsgefäß (Kein Schraubdeckel! Kein Parafilm!)
Weitere Formate (96-wells, 8er-Strips) auf Anfrage

Spezifikationen

DNA Länge (bp) DNA-Konzentration PremixSingleRun ComfortRun
 PCR Produkte 150-400 20ng/µl 8µl DNA plus 2µl (5pmol/µl) Primer 12µl DNA
400-700 30ng/µl
700-1500 50ng/µl
>1500 80ng/µl
Plasmide >2000 100 ng/µl

Sequenzierungen

  • Genom-Sequenzierung (Sequenzierung kleinerer Genome, z. B. von Bakterien, Viren, Pflanzen)
    Charakterisierung der Genomstruktur durch „mate pair sequencing“
  • RNA-Sequenzierung (Transkriptom, komplett oder nur kodierend [„expression profiling“]; „miRNA“)
  • Exom-Sequenzierung
  • Amplikon-Sequenzierung („ultra-deep sequencing“)
    • Mikrobiologie (Bakteriologie [16S Metagenomik],
    • Virologie („Ultra-Deep Sequencing“, „Virusdynamik“)
    • Produkt-, Qualitätskontrollen

Leselängen (nts): 1 X 36, 2 X 25, 2 x 75, 2 x 150, 2 x 250 (nur MiSeq), 2 x 300 (nur MiSeq)

Projektplanung und individuell angepasste Bioinformatik

  • Preisbeispiel: B. E.coli (4,6MB) kein Assembly, etc.            275,-